基因型数据格式转换

本页面提供了将 VCF 格式的基因型数据转换为 PLINK 格式的功能。 PLINK 格式是遗传学分析的标准数据格式，支持多种分析场景，如 GWAS 和群体结构分析。

传入数据

• VCF 文件：包含变异位点和样本基因型数据。
• 文件格式要求：标准 VCF 格式（Version 4.0 及以上）。

转换参数

• --make-bed：生成二进制 PLINK 文件（.bed, .bim, .fam）。
• --allow-extra-chr：处理非标准染色体编号（如小麦的 1A、1B）。
• --not-chr Un：排除不确定染色体数据。

生成结果

• .bed 文件：包含所有样本的基因型数据。
• .bim 文件：包含位点的详细信息。
• .fam 文件：包含样本的家系和表型信息。

示例文件